Vědecká rada je nejvyšším odborným orgánem AZV.

Složení Vědecké rady, způsob její činnosti, podmínky nepodjatosti členů Vědecké rady, způsob nakládání s údaji obsaženými v návrzích Projektů jsou upraveny Statutem a jednacím řádem Vědecké rady a Panelů AZV.

Vědecká rada má nejvýše 16 členů, včetně předsedy a místopředsedy. Předsedu Vědecké rady jmenuje a odvolává předseda AZV na návrh odborné veřejnosti a MZ. Ostatní členy jmenuje a odvolává předseda AZV na návrh MZ. Členy Vědecké rady jsou předsedové Panelů a další zástupci odborné veřejnosti. Předseda Vědecké rady se po dobu výkonu funkce nemůže ucházet o účelovou podporu v pozici navrhovatele/řešitele nebo spolunavrhovatele/spoluřešitele Projektu.

V čele Vědecké rady je předseda a místopředseda. Členům Vědecké rady za výkon činností spojených s výkonem funkce náleží odměna, jejíž návrh stanoví předsednictvo AZV.

Vědecká rada zejména:

a) Posuzuje odborné hodnocení Projektů navržené jednotlivými Panely a stanovuje návrh celkového pořadí Projektů pro poskytnutí účelové podpory;

b) Předkládá předsednictvu AZV ke schválení hodnocení dílčích a závěrečných zpráv o řešení Projektů;

c) Navrhuje předsednictvu AZV zaměření zdravotnického výzkumu a vývoje a zřízení nebo zrušení Panelů, vyhodnocuje vědeckou úroveň Projektů a navrhuje předsednictvu AZV potřebná opatření.

Členové Vědecké rady AZV ČR:

prof. MUDr. Jiří Litzman, CSc. (předseda)

prof. MUDr. Luděk Červenka, CSc., MBA (místopředseda) 

prof. MUDr. Martin Haluzík, DrSc. – 1. panel 

prof. MUDr. Milan Štengl, Ph.D. – 2. panel 

doc. Mgr. Jiří Šána, Ph.D. – 3. panel 

prof. MUDr. Evžen Růžička, DrSc., FCMA, FEAN – 4. panel 

doc. Mgr. Martina Lengerová, Ph.D. – 5. panel

prof. MUDr. Ivan Čundrle, Ph.D. – 6. panel

prof. MUDr. Eva Froňková, Ph.D. – 7. panel 

prof. MUDr. Jakub Otáhal, , Ph.D. – 8. panel

doc. PhDr. Radka Bužgová, Ph.D. – 9. panel

prof. MUDr. Jiří Chomiak, CSc. – 10. panel 

Další členové VR AZV:

prof. MUDr. Vladimír Beneš, DrSc. 

doc. MUDr. Tomáš Kazda, Ph.D.

prof. MUDr. Miroslav Zavoral, Ph.D.

prof. MUDr. Zuzana Moťovská, Ph.D.